Pemilihan Rektor merupakan agenda rutin yang dilaksanakan lima tahun sekali oleh Universitas Trunojoyo untuk menentukan Rektor periode berikutnya, pemilihan rektor saat ini masih dilakukan dengan cara manual, kendala yang dihadapi adalah terjadinya kecurangan dan tidak efisien. Pada penelitian ini dirancang protokol dan simulasi sistem e-voting pada pemilihan rektor. Fungsi-fungsi pada sistem ini disesuaikan dengan skema e-voting yang harus memenuhi beberapa kriteria, yaitu Eligibility, Unreusability, Anonymity, Accuracy, Fairness, Vote and Go, dan Public Verifiability. Protokol ini akan digunakan untuk sistem pendaftaran pemilih, validasi pemilih, sistem pemilihan, dan sistem perhitungan suara. Untuk menjaga kerahasiaan pilihan pemilih, sistem e-voting ini menggunakan algoritma blind signature. Hasil dari penelitian ini adalah sebuah sistem e-voting berbasis web yang menggunakan otentikasi finger print untuk mencegah terjadinya pemilihan kolektif. Hasil penelitian ini berdasarkan kusioner kepuasan pengguna yang disebar kepada responden dapat disimpulkan baik dan menunjukkan bahwa e-voting dapat mempercepat proses perhitungan suara dan meminimalisir kesalahan perhitungan yang dapat terjadi jika dilakukan secara manual oleh manusia. Kata kunci: E-voting, fingerprint, web, pemilihan umum, blind signature.

Rector election is a regular agenda carried every five years by the Trunojoyo University to determine a rector the next period, the election of the rector is still done manually, constraints are fraud and inefficient. In this study, the protocol designed and simulated e-voting systems on election rector. Functions on the system adapted to e-voting scheme that must meet several criteria, ie eligibility, Unreusability, Anonymity, Accuracy, Fairness, Vote and Go, and public verifiability. This protocol will be used for voter registration systems, validation of voters, election system, and the vote counting system. To maintaining the confidentiality of voter choice, e-voting system uses a blind signature algorithm. The results of this study is an e-voting system using web-based fingerprint authentication to prevent collective choice. The results are based on the user satisfaction questionnaire were distributed to the respondents can be concluded well and shows that e-voting can speed up the process of counting and minimize errors that can occur if the calculation is done manually by humans. Keywords: E-voting, fingerprint, web, elections, blind signature.